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如果清理了苹果手机的短信，想要恢复的话，可以尝试以下几种方法。
1、iTunes备份恢复：如果之前有使用iTunes备份过手机数据，那么可以通过iTunes恢复被删除的短信，具体操作是连接iPhone到电脑上，然后运行iTunes软件，选择从备份中恢复并选取之前备份好的文件来恢复数据，但这种方法可能无法恢复最近一段时间内的所有数据。
2、iCloud备份恢复：如果开启了iCloud备份功能，可以通过iCloud备份恢复删除的短信，连接iPhone到Wi-Fi网络，并输入自己的Apple ID和密码来登录iCloud，选择备份的数据来恢复短信数据，同样，这也可能无法恢复近期删除的数据。
3、使用第三方软件恢复：市面上有一些第三方软件可以扫描并恢复手机删除的短信，例如通过数据线连接手机后，根据软件界面提示选择“开始扫描”功能来尝试恢复删除的短信，但使用这种方式恢复数据时需要注意保护个人隐私，避免泄露重要信息。
无论是使用iTunes还是iCloud恢复数据，都需要在清理短信前已经进行过备份，如果没有进行备份，那么可能无法恢复已删除的短信，数据恢复可能涉及到个人隐私和安全，建议使用官方或信誉良好的第三方软件进行操作，并确保操作过程中的安全性，如果以上方法均无法恢复数据，建议寻求专业的技术支持或咨询苹果官方客服协助解决。